torsdag den 6. marts 2014

Hvordan genskaber vi mammutten?

Vi har fundet en mammut, og taget noget af dens DNA.
DNA ligger inde i cellekernen, omgivet af proteiner og for at komme ind til DNA'et skal vi først nedbryde cellekernen og cellembranen, det gør vi ved hjælp af opvaskemiddel, som er fedtopløseligt, fordi sæbemolekyler er specielle ved at de både kan tiltrække vand og fedstof, hvilket de kan, fordi de er halvt polære og ikke polære. 
Efter det skal vi nedbryde proteinerne, det gør vi ved at kommet noget protease i, som er et enzym, der spalter proteinerne, sådan at proteiner og DNA kommer hver for sig. 

Kopiring af DNA.
DNA'et kommes ned i et meget lille rør, som sættes ned i PCR-maskine, hvor man så tilsætter enzymer og nuklider, PCR-maskinen gør så at den varmer op, hvor DNA'et bliver skildt ad, hvorefter det bliver kølet ned igen, og enzymerne sætter sig på, hvilket forsætter til man kopiret DNA'et flere gange. 

Kloningen. 
Det oprensede DNA (cellekernen på billedet) sættes ind i en ægcelle fra en Elefant og der tilsættes kemikalier og elektrisitet, på den måde kommer cellen til at tro at den er et befrugtet æg. Ægget begynder at dele sig og forvandler sig til et embryon som i starten består af embryonale stamceller som kan udvilke sig til alle celler i kroppen. De embryonale stamceller tilpasser sig og man kan få dem til at udhvikle sig til et foster ved at sætte dem op i en livmoder. 


Vi skal squ klone en mammut


Det af klone en Mammut. 

Først skal vi pakke vores tasker og rejse til Sibrien. Derefter have arbejdstøjet på, og grave med en spade. 
Vi skal grave ned til permafrosten, hvor efter vi finder den store boremaskine frem og bore en prøve ud.  En sådan ekspedition kan tage fire måneder. 
Når vi har nok jordprøver rejser vi tilbage til vores laboratorium. Vi renser jordprøverne og udskiller DNA'en. 






 







Udskilning af DNA. 

Når vi har udskilt al DNA'en, skal vi have replikeret vores DNA, ved hjælp af en molekylær biologisk teknik der kaldes PCR (Polymerase Chain Reaction). Denne teknik udnytter et enzym der kan holde til kraftigere varme end vores egne enzymer til at opformere en bestemt DNA sekvens. Med PCR er det altså nemt at skabe millioner af DNA kopier fra så let som 1 DNA streng. 

















Nu har vi millioner af DNA sekvenser, så nu vil vi finde ud af om det er de rigtige vi har. Det gør vi ved hjælp af Gelelektrofoese der benyttes det at sammenligne DNA materiale - Hvor man leder efter et match i DNA'en som vi kan se om det er mammut DNA eller DNA fra et andet dyr. 

Det fungere ved hjælp af et restriktionsenzym klipper DNA'et i stykker. Hvor det klippes afhænger af det enkelte enzym. Og Man vil så benytte det samme enzym på de forskellige DNA materialer, så man kan fortage en sammenligning af resultaterne. 
Når gel materialet, placeres ned i elektrolysekaret, tilsættes DNA'et i brøndende. Derefter tilsættes en buffervæske og strøm. 
Da DNA indholder fosfat-ioner som er negativ ladet, derfor vil de små DNA stykker bevæge sig imod den positive ende af karet. Derved kan vi aflæse om DNA'et passer på vores mammut kontrol prøve. 

Men vi kan desværre ikke bruge vores mammut DNA her da vi mangler en masse DNA sekvenser, så derfor tager vi celler fra en anden mammut, En hel mammut fundet i permafrosten. Der udskiller vi også DNA'en fra de forskellige celler og opformere dem ved hjælp af PCR. Når vi så har nok hele DNA-sekvenser er vi klar til at bruge dem til kloning.

Selve kloningen vil foregår ved at vi tager et æg fra en Indisk elefant og fjerne det DNA der oprindeligt er i ægget, derefter indsætter vi vores mammut DNA i ægget. Når vi har tilsat mammutens arvemateriale til den indiske elefants æg tilsætter vi noget kemisk(ja klaus vi ved godt det ikke er præcist nok) i en petriskål så ægget deler sig. 
Når ægget har delt sig indfører vi det i hun elefanten som så vil agere rugemor for vores voksende mammut.
Hun vil gå drægtig i omkring 600 dage og derefter føde en klon af den mammut vi har fundet i permafrosten.

 









Sådan kloner du en mammut

1. Først skal man finde noget dna fra en mammut. Dna'et finder man i cellekernen. 

2. Dette dna skal oprenses, ligesom man gjorde med kiwien. Der tilføres opvaskemiddel og protease, sådan at cellekernemembranen forsvinder rundt om dna'et. Membranen er nemlig lavet af fedt og opvaskemiddel er fedtopløseligt og protease nedbryder proteinerne omkring dna'et. 

3. Det oprensede dna skal nu kopieres og dette gøres med pcr-metoden. I løbet af en formiddag er der 1.000.000.000 kopiere af dna'et fra mamutten. PCR er en forkortelse af det engelske navn “Polymerase chain reaction”. Ved pcr-metoden denatureres DNA ved opvarmning. Herefter følger en nedkøling hvor primere bindes til hver sin DNA-streng. Derefter kopiers DNA-strengene.

4. Dna'et skal nu indsættes i et æg uden arvemateriale fra en indisk elefant. En indisk elefant er det dyr der er nærmest beslægtet med mamutten og det giver dermed størst chance for succes.

5. Ægget indsættes nu i livmoderen på den indiske elefant og efter 600 dage bliver den indiske elefant mor til en sød lille mammutunge.